Проф. А. С. Кветная награждена почетной грамотой Минздрава России (1996), знаком «Отличник здравоохранения» (2001), медалью ордена «За заслуги перед Отечеством II степени» (2003), медалью «В память 300-летия Санкт-Петербурга» (2003), дипломом Комитета по науке и высшей школе Правительства Санкт-Петербурга за лучший инновационный проект в сфере науки и высшего образования в номинации «Лучшая научно-инновационная идея 2008 года» (2008); является почетным доктором Детского научно-клинического центра инфекционных болезней (2016).